16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3578 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3578  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  327  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1721  hypothetical protein  90.91 
 
 		 165 aa  271  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0457943  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4266  hypothetical protein  79.64 
 
 		 167 aa  246  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1715  hypothetical protein  75.15 
 
 		 166 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.853434  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2964  hypothetical protein  67.88 
 
 		 164 aa  217  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.895245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2687  hypothetical protein  61.21 
 
 		 166 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2274  hypothetical protein  54.55 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.458823  normal  0.137703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1775  hypothetical protein  54.3 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5053  hypothetical protein  52.32 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581815  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1793  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.00000000099391  normal  0.104146 
 
 
 
NC_007778  RPB_1018  hypothetical protein  46.3 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2062  hypothetical protein  44.71 
 
 		 171 aa  143  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4347  hypothetical protein  52.78 
 
 		 144 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0078  hypothetical protein  45.39 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0529  hypothetical protein  41.61 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5027  hypothetical protein  40.88 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>