16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4266 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4266  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  331  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636796  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3578  hypothetical protein  79.64 
 
 
165 aa  247  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1721  hypothetical protein  83.83 
 
 
165 aa  246  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0457943  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1715  hypothetical protein  71.69 
 
 
166 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.853434  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2964  hypothetical protein  69.03 
 
 
164 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.895245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2687  hypothetical protein  65.79 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2274  hypothetical protein  59.33 
 
 
166 aa  180  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.458823  normal  0.137703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1775  hypothetical protein  55.63 
 
 
159 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1793  hypothetical protein  50.99 
 
 
165 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.00000000099391  normal  0.104146 
 
 
 
NC_009485  BBta_4347  hypothetical protein  54.01 
 
 
144 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5027  hypothetical protein  43.4 
 
 
161 aa  137  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5053  hypothetical protein  47.37 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1018  hypothetical protein  48.65 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2062  hypothetical protein  44.44 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0078  hypothetical protein  44.37 
 
 
168 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0529  hypothetical protein  43.94 
 
 
190 aa  117  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.90265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>