16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1775 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1775  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  317  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1793  hypothetical protein  89.31 
 
 		 165 aa  286  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.00000000099391  normal  0.104146 
 
 
 
NC_007925  RPC_1715  hypothetical protein  59.87 
 
 		 166 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.853434  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2964  hypothetical protein  55.26 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.895245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2687  hypothetical protein  49.37 
 
 		 166 aa  156  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4266  hypothetical protein  55.63 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636796  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1721  hypothetical protein  54.55 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0457943  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3578  hypothetical protein  53.79 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2274  hypothetical protein  46.2 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.458823  normal  0.137703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4347  hypothetical protein  54.01 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1018  hypothetical protein  45.57 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5053  hypothetical protein  45.39 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581815  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0529  hypothetical protein  50 
 
 		 190 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2062  hypothetical protein  44.14 
 
 		 171 aa  127  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0078  hypothetical protein  47.86 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5027  hypothetical protein  41.1 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>