16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2964 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2964  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  327  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.895245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2687  hypothetical protein  64.85 
 
 
166 aa  202  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1715  hypothetical protein  66.27 
 
 
166 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.853434  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3578  hypothetical protein  67.88 
 
 
165 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4266  hypothetical protein  69.03 
 
 
167 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636796  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1721  hypothetical protein  74.24 
 
 
165 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0457943  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2274  hypothetical protein  63.33 
 
 
166 aa  183  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.458823  normal  0.137703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1775  hypothetical protein  55.26 
 
 
159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1793  hypothetical protein  50.31 
 
 
165 aa  158  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.00000000099391  normal  0.104146 
 
 
 
NC_009485  BBta_4347  hypothetical protein  51.88 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2062  hypothetical protein  46.9 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5053  hypothetical protein  46.1 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1018  hypothetical protein  45.34 
 
 
163 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0078  hypothetical protein  47.76 
 
 
168 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5027  hypothetical protein  41.1 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0529  hypothetical protein  39.41 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.90265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>