16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1715 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1715  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.853434  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3578  hypothetical protein  75.15 
 
 		 165 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1721  hypothetical protein  75.15 
 
 		 165 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0457943  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2964  hypothetical protein  66.27 
 
 		 164 aa  216  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.895245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4266  hypothetical protein  71.69 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636796  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2687  hypothetical protein  64.24 
 
 		 166 aa  207  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2274  hypothetical protein  63.33 
 
 		 166 aa  190  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.458823  normal  0.137703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1775  hypothetical protein  59.87 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1793  hypothetical protein  53.29 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.00000000099391  normal  0.104146 
 
 
 
NC_011004  Rpal_5053  hypothetical protein  50.94 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5027  hypothetical protein  44.03 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2062  hypothetical protein  41.52 
 
 		 171 aa  137  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0078  hypothetical protein  56.03 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1018  hypothetical protein  46.91 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4347  hypothetical protein  50.68 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0529  hypothetical protein  48.48 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>