268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2528 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2528  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
149 aa  312  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2799  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.6 
 
 
149 aa  290  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.792463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2940  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  89.26 
 
 
149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.593283  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2794  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.92 
 
 
149 aa  283  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  86.58 
 
 
149 aa  283  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.306746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  85.91 
 
 
149 aa  279  7.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.448807  normal  0.290697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4033  lactoylglutathione lyase  84 
 
 
150 aa  266  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2466  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.11 
 
 
146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2056  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.13 
 
 
145 aa  208  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0347732  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0266  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.44 
 
 
146 aa  207  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407203  hitchhiker  0.00996866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1734  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.77 
 
 
146 aa  207  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.77 
 
 
146 aa  205  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.459342  normal  0.516309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.1 
 
 
146 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773875  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0685  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.46 
 
 
146 aa  206  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.858158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0511  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.1 
 
 
146 aa  205  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1229  lactoylglutathione lyase  63.76 
 
 
173 aa  205  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0440  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.1 
 
 
146 aa  204  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676404 
 
 
-
 
NC_004310  BR1268  lactoylglutathione lyase  63.76 
 
 
146 aa  204  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2283  lactoylglutathione lyase  65.1 
 
 
146 aa  204  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.086376  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.1 
 
 
146 aa  203  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000851602  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1450  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.77 
 
 
146 aa  202  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582503  hitchhiker  0.000352028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0854  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.43 
 
 
146 aa  201  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.576293  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1922  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.42 
 
 
146 aa  201  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1549  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.43 
 
 
146 aa  200  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2560  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.76 
 
 
146 aa  200  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195518  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1843  hypothetical protein  62.42 
 
 
146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.42 
 
 
147 aa  197  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1846  hypothetical protein  62.42 
 
 
146 aa  196  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.74 
 
 
146 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.53 
 
 
152 aa  193  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0199  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.07 
 
 
146 aa  192  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616516 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.06 
 
 
146 aa  192  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4172  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.42 
 
 
140 aa  189  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.73 
 
 
139 aa  183  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3401  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.72 
 
 
146 aa  181  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356805  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0767  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.26 
 
 
142 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0935  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.94 
 
 
142 aa  177  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.265763  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1730  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.28 
 
 
142 aa  176  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.94 
 
 
142 aa  174  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0442076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0845  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.28 
 
 
142 aa  173  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0685  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.39 
 
 
145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2045  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.29 
 
 
142 aa  167  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189264  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0392  lactoylglutathione lyase  55.63 
 
 
142 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.730613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2191  lactoylglutathione lyase  54.67 
 
 
139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3037  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.9 
 
 
145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1662  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.02 
 
 
143 aa  154  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.65 
 
 
140 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.029939 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14348  predicted protein  47.22 
 
 
132 aa  137  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239134  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  45.19 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  42.47 
 
 
137 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  39.47 
 
 
143 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  39.47 
 
 
143 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  38.24 
 
 
128 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  36.57 
 
 
128 aa  103  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  42.96 
 
 
129 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  40.58 
 
 
137 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  42.22 
 
 
129 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  45.19 
 
 
128 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  40.71 
 
 
132 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  40 
 
 
136 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  43.7 
 
 
129 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  44.44 
 
 
128 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  41.79 
 
 
145 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  42.65 
 
 
131 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  42.96 
 
 
129 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  40.74 
 
 
129 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  39.26 
 
 
136 aa  100  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  40.74 
 
 
238 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  37.04 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  42.11 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  41.79 
 
 
127 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  37.75 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  40.44 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  40.74 
 
 
129 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  40.74 
 
 
129 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02739  glyoxalase I, nickel isomerase (Lactoylglutathione lyase)  38.64 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.206063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  40.74 
 
 
129 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  40.74 
 
 
129 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  40.74 
 
 
129 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  40.74 
 
 
129 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  36.57 
 
 
127 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  37.68 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2450  lactoylglutathione lyase  40 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00862071  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  41.79 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6549  lactoylglutathione lyase  41.18 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  37.96 
 
 
138 aa  96.7  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  36.23 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  40.3 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  36.23 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2037  lactoylglutathione lyase  37.04 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  36.62 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  40.74 
 
 
132 aa  93.6  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  40.58 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  39.13 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  38.69 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  36.96 
 
 
129 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  35.82 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  34.33 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  38.52 
 
 
138 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  38.52 
 
 
138 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>