276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1730 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1730  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
142 aa  298  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78.17 
 
 
142 aa  245  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0442076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0935  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78.17 
 
 
142 aa  243  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.265763  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2045  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78.17 
 
 
142 aa  238  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189264  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0392  lactoylglutathione lyase  77.46 
 
 
142 aa  237  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.730613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0845  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  77.46 
 
 
142 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0767  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.05 
 
 
142 aa  220  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.92 
 
 
139 aa  206  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0685  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.19 
 
 
146 aa  188  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.858158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.84 
 
 
146 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000851602  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3037  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.19 
 
 
145 aa  186  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1549  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.84 
 
 
146 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1450  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.49 
 
 
146 aa  185  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582503  hitchhiker  0.000352028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1734  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.49 
 
 
146 aa  183  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2466  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.84 
 
 
146 aa  183  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2283  lactoylglutathione lyase  62.16 
 
 
146 aa  182  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.086376  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.81 
 
 
146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.459342  normal  0.516309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0440  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.14 
 
 
146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0685  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.89 
 
 
145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.49 
 
 
146 aa  179  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0386322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0511  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.78 
 
 
146 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.6 
 
 
149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.306746  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0854  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.14 
 
 
146 aa  177  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.576293  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.04 
 
 
152 aa  177  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2794  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.28 
 
 
149 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2528  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.28 
 
 
149 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.07 
 
 
147 aa  175  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2056  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.16 
 
 
145 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0347732  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4172  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.15 
 
 
140 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1843  hypothetical protein  58.11 
 
 
146 aa  174  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0266  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.11 
 
 
146 aa  172  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407203  hitchhiker  0.00996866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.43 
 
 
146 aa  173  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659372 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1846  hypothetical protein  58.11 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2940  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.63 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.593283  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2799  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.29 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.792463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0199  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.46 
 
 
146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616516 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1922  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.43 
 
 
146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.95 
 
 
149 aa  169  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.448807  normal  0.290697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1662  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.87 
 
 
143 aa  169  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1229  lactoylglutathione lyase  56.08 
 
 
173 aa  167  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4033  lactoylglutathione lyase  57.24 
 
 
150 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.73 
 
 
146 aa  167  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1268  lactoylglutathione lyase  56.08 
 
 
146 aa  167  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2191  lactoylglutathione lyase  59.15 
 
 
139 aa  163  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2560  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.38 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3401  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.05 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356805  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.17 
 
 
140 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.029939 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14348  predicted protein  53.33 
 
 
132 aa  143  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  38.69 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6549  lactoylglutathione lyase  39.06 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  37.5 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  42.42 
 
 
129 aa  91.3  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  42.75 
 
 
128 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  39.69 
 
 
135 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  40.94 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  39.69 
 
 
135 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  39.69 
 
 
135 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  39.69 
 
 
135 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  39.69 
 
 
135 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  39.37 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  40.15 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  36.72 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  40.16 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02261  putative lactoylglutathione lyase  41.27 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0600753  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  40.15 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  40.15 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  40.15 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  40.15 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  40.15 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  40.15 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  40.15 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  39.84 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  40.15 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07081  glyoxalase I  37.8 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  39.37 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  37.14 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  40.62 
 
 
129 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  36.57 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06791  glyoxalase I  37.8 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0508996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  39.37 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0652  glyoxalase I  36.22 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02739  glyoxalase I, nickel isomerase (Lactoylglutathione lyase)  38.71 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.206063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  39.1 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  35.21 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  36.22 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  41.09 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  39.39 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  41.86 
 
 
128 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  36.72 
 
 
127 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  40.62 
 
 
238 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  39.37 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  40.62 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  40.62 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  40.62 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  40.62 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  40.62 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  40.62 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  41.09 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  41.09 
 
 
129 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  40.46 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>