18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2275 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2275  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65326  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0995  hypothetical protein  96.3 
 
 		 108 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43164  decreased coverage  0.00000531254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2654  putative conjugal transfert protein, TraC  82.41 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0271  putative conjugal transfert protein, TraC  82.41 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0638011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0441  putative conjugal transfert protein, TraC  81.13 
 
 		 108 aa  170  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618371  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4519  hypothetical protein  84.69 
 
 		 127 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0436  putative conjugual transfert protein, traC  81.13 
 
 		 108 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0148  hypothetical protein  76.85 
 
 		 113 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.586949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0099  hypothetical protein  77.89 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3949  hypothetical protein  75 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1544  hypothetical protein  68.22 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185841  normal  0.304828 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4225  hypothetical protein  68.22 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3229  hypothetical protein  77.01 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3192  hypothetical protein  51.85 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0327  putative conjugal transfert protein, TraC  70.67 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3572  hypothetical protein  52.29 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.120151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1151  hypothetical protein  66.22 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0125186  hitchhiker  0.0000023633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0179  hypothetical protein  50.93 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>