18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0436 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0436  putative conjugual transfert protein, traC  100 
 
 		 108 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2654  putative conjugal transfert protein, TraC  86.92 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0271  putative conjugal transfert protein, TraC  86.92 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0638011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0441  putative conjugal transfert protein, TraC  83.18 
 
 		 108 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618371  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2275  hypothetical protein  81.13 
 
 		 110 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65326  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0995  hypothetical protein  80.19 
 
 		 108 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43164  decreased coverage  0.00000531254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0148  hypothetical protein  74.77 
 
 		 113 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.586949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4519  hypothetical protein  80.61 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3949  hypothetical protein  76.64 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0099  hypothetical protein  75.79 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1544  hypothetical protein  69.16 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185841  normal  0.304828 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4225  hypothetical protein  69.16 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3229  hypothetical protein  70.37 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3192  hypothetical protein  54.21 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0327  putative conjugal transfert protein, TraC  60 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1151  hypothetical protein  66.22 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0125186  hitchhiker  0.0000023633 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3572  hypothetical protein  49.54 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.120151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0179  hypothetical protein  51.4 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>