18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3949 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3949  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  260  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4519  hypothetical protein  78.99 
 
 		 127 aa  189  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0148  hypothetical protein  76.99 
 
 		 113 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.586949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2654  putative conjugal transfert protein, TraC  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0271  putative conjugal transfert protein, TraC  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0638011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0436  putative conjugual transfert protein, traC  76.64 
 
 		 108 aa  166  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2275  hypothetical protein  75 
 
 		 110 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65326  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0441  putative conjugal transfert protein, TraC  73.83 
 
 		 108 aa  163  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618371  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0995  hypothetical protein  72.22 
 
 		 108 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43164  decreased coverage  0.00000531254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1544  hypothetical protein  64.86 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185841  normal  0.304828 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4225  hypothetical protein  64.86 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0099  hypothetical protein  66.67 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3229  hypothetical protein  65.52 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3192  hypothetical protein  52.78 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0327  putative conjugal transfert protein, TraC  64 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3572  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.120151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1151  hypothetical protein  62.16 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0125186  hitchhiker  0.0000023633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0179  hypothetical protein  47.22 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>