18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4519 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4519  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0148  hypothetical protein  86.14 
 
 		 113 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.586949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3949  hypothetical protein  78.99 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2275  hypothetical protein  84.69 
 
 		 110 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65326  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0995  hypothetical protein  82.65 
 
 		 108 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43164  decreased coverage  0.00000531254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2654  putative conjugal transfert protein, TraC  80.81 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0271  putative conjugal transfert protein, TraC  80.81 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0638011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0441  putative conjugal transfert protein, TraC  81.63 
 
 		 108 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618371  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0099  hypothetical protein  77.78 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0436  putative conjugual transfert protein, traC  80.61 
 
 		 108 aa  155  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1544  hypothetical protein  73.47 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185841  normal  0.304828 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4225  hypothetical protein  73.47 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3229  hypothetical protein  74.71 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3192  hypothetical protein  60.49 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0327  putative conjugal transfert protein, TraC  70.67 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1151  hypothetical protein  66.22 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0125186  hitchhiker  0.0000023633 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3572  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.120151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0179  hypothetical protein  48.98 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>