18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2654 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2654  putative conjugal transfert protein, TraC  100 
 
 
112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0271  putative conjugal transfert protein, TraC  100 
 
 
112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0638011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0441  putative conjugal transfert protein, TraC  91.59 
 
 
108 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618371  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0436  putative conjugual transfert protein, traC  86.92 
 
 
108 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2275  hypothetical protein  82.41 
 
 
110 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65326  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0995  hypothetical protein  81.48 
 
 
108 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43164  decreased coverage  0.00000531254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0148  hypothetical protein  72.97 
 
 
113 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.586949  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0099  hypothetical protein  80.81 
 
 
112 aa  163  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4519  hypothetical protein  80.81 
 
 
127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3949  hypothetical protein  73.21 
 
 
130 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1544  hypothetical protein  69.37 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185841  normal  0.304828 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4225  hypothetical protein  69.37 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454251  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3229  hypothetical protein  76.14 
 
 
108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227283  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3192  hypothetical protein  52.78 
 
 
101 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0327  putative conjugal transfert protein, TraC  71.62 
 
 
88 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1151  hypothetical protein  62.92 
 
 
88 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0125186  hitchhiker  0.0000023633 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3572  hypothetical protein  53.41 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.120151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0179  hypothetical protein  49.07 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>