18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1151 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1151  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  170  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0125186  hitchhiker  0.0000023633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0327  putative conjugal transfert protein, TraC  85.88 
 
 
88 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3229  hypothetical protein  66.27 
 
 
108 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227283  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2654  putative conjugal transfert protein, TraC  62.92 
 
 
112 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0441  putative conjugal transfert protein, TraC  68.92 
 
 
108 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618371  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0271  putative conjugal transfert protein, TraC  62.92 
 
 
112 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0638011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0995  hypothetical protein  59.09 
 
 
108 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43164  decreased coverage  0.00000531254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4519  hypothetical protein  62.2 
 
 
127 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0099  hypothetical protein  63.1 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1544  hypothetical protein  57.95 
 
 
112 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185841  normal  0.304828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2275  hypothetical protein  66.22 
 
 
110 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65326  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4225  hypothetical protein  57.95 
 
 
112 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454251  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0436  putative conjugual transfert protein, traC  66.22 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3949  hypothetical protein  62.16 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3192  hypothetical protein  56.04 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0148  hypothetical protein  62.16 
 
 
113 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.586949  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3572  hypothetical protein  55.95 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.120151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0179  hypothetical protein  52.38 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>