89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1756 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1756  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.489985  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3540  hypothetical protein  61.95 
 
 		 114 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279096  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1925  hypothetical protein  45.79 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.248108  normal  0.550673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0316  protein of unknown function DUF86  44.12 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0422358 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1695  hypothetical protein  35.85 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.398533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3537  hypothetical protein  35.92 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  34.34 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1732  protein of unknown function DUF86  37.76 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0370  hypothetical protein  35.64 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.823692  normal  0.271446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0375  hypothetical protein  36.27 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1037  protein of unknown function DUF86  36.17 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0341749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3038  protein of unknown function DUF86  39.8 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0409  protein of unknown function DUF86  35.24 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0398458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  30.3 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  35.05 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  35.11 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1179  hypothetical protein  31.93 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0194477  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  39.47 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0274  hypothetical protein  37.76 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1947  protein of unknown function DUF86  35.35 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1958  protein of unknown function DUF86  35.35 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3689  hypothetical protein  31.96 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.119376  hitchhiker  0.00953852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1229  hypothetical protein  37 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.949454  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  29.25 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2482  hypothetical protein  30.19 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2423  hypothetical protein  37.76 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  28.3 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0872  protein of unknown function DUF86  30.3 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2193  hypothetical protein  32.17 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0089  hypothetical protein  30.09 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1805  protein of unknown function DUF86  27.72 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4166  hypothetical protein  35.79 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0899  hypothetical protein  27.36 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84236  unclonable  0.000014673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1076  protein of unknown function DUF86  32.65 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.814498  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2533  hypothetical protein  31.63 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126172 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.855839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0280  protein of unknown function DUF86  40 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0338136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  31.13 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0257  protein of unknown function DUF86  35.94 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  31.13 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3141  protein of unknown function DUF86  29.36 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3145  protein of unknown function DUF86  32.99 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2968  protein of unknown function DUF86  29.36 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  36.36 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1341  protein of unknown function DUF86  32.32 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0373  hypothetical protein  28.57 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.368479  normal  0.363257 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2071  protein of unknown function DUF86  31.68 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1765  protein of unknown function DUF86  34.69 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0480  hypothetical protein  28.28 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2496  protein of unknown function DUF86  29.7 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  33 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1880  protein of unknown function DUF86  26.42 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1854  protein of unknown function DUF86  26.42 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3298  protein of unknown function DUF86  30.39 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3744  protein of unknown function DUF86  25 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0685  hypothetical protein  29.03 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.923318  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0358  hypothetical protein  25.25 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1202  hypothetical protein  30.7 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0520235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0032  hypothetical protein  30.11 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.89444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4908  protein of unknown function DUF86  38.96 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0410  hypothetical protein  42.59 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1293  protein of unknown function DUF86  38.98 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.053291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3118  hypothetical protein  27.55 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1474  protein of unknown function DUF86  29.63 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.173165  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1112  hypothetical protein  32.04 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0885  hypothetical protein  31.17 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152206  hitchhiker  0.00000000727244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1935  protein of unknown function DUF86  29.89 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0846  hypothetical protein  27.03 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  27.27 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  27.27 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1969  hypothetical protein  27.27 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2758  hypothetical protein  24.32 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  24.74 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2671  hypothetical protein  36.08 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.850866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3032  hypothetical protein  25.26 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.488274 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1729  hypothetical protein  23.08 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.993735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4026  hypothetical protein  27.96 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1083  protein of unknown function DUF86  29.23 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  28.24 
 
 		 111 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0233  hypothetical protein  25.24 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  28.72 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2417  hypothetical protein  28.87 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2973  protein of unknown function DUF86  27.54 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3136  protein of unknown function DUF86  27.54 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.29369 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0018  ISSod9 hypothetical protein  27.06 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.231151  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0169  ISSod9 hypothetical protein  27.06 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.194296  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1653  hypothetical protein  30.36 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>