45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0410 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0410  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  169  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  52.31 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  43.48 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1695  hypothetical protein  48.53 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.398533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4166  hypothetical protein  46.48 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1076  protein of unknown function DUF86  53.33 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.814498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1947  protein of unknown function DUF86  46.67 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1958  protein of unknown function DUF86  46.67 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3689  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.119376  hitchhiker  0.00953852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2533  hypothetical protein  45.07 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2496  protein of unknown function DUF86  40 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3744  protein of unknown function DUF86  44.93 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2482  hypothetical protein  44.26 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  43.33 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1037  protein of unknown function DUF86  38.6 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0341749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0549  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  40 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0948  hypothetical protein  35 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.774852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  38.46 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1756  hypothetical protein  42.59 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.489985  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  31.25 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2149  protein of unknown function DUF86  45.1 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1407  hypothetical protein  45.1 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50240  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.753692  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0373  hypothetical protein  36.67 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.368479  normal  0.363257 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1341  protein of unknown function DUF86  35.48 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3537  hypothetical protein  38.24 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1805  protein of unknown function DUF86  37.04 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0899  hypothetical protein  31.67 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84236  unclonable  0.000014673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1880  protein of unknown function DUF86  29.03 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1854  protein of unknown function DUF86  29.03 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3032  hypothetical protein  32.31 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.488274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  39.68 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279096  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1083  protein of unknown function DUF86  46.34 
 
 		 83 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1813  hypothetical protein  37.04 
 
 		 122 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.691748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1653  hypothetical protein  33.85 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12899 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5351  hypothetical protein  35.82 
 
 		 128 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3038  protein of unknown function DUF86  29.03 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0169  ISSod9 hypothetical protein  39.22 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.194296  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0885  hypothetical protein  31.75 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152206  hitchhiker  0.00000000727244 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0018  ISSod9 hypothetical protein  39.22 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.231151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>