23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0625 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0625  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  324  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.378241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0494  hypothetical protein  66.9 
 
 		 168 aa  183  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.690027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0544  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  62.67 
 
 		 175 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0331  hypothetical protein  56.8 
 
 		 169 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3495  hypothetical protein  54.49 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0740  hypothetical protein  52.2 
 
 		 200 aa  141  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0803739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1098  hypothetical protein  62.96 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  0.172733 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0628  hypothetical protein  51.08 
 
 		 216 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0799626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3738  hypothetical protein  48.73 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  0.0272563 
 
 
-
 
NC_004310  BR0633  hypothetical protein  51.08 
 
 		 216 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0836071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2682  hypothetical protein  49.35 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2650  hypothetical protein  47.92 
 
 		 274 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384111  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1625  putative signal peptide  40.24 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.104398 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0599  hypothetical protein  44.06 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1692  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  41.07 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7624  hypothetical protein  56.52 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2733  hypothetical protein  48.15 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0759  hypothetical protein  57.97 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8807  hypothetical protein  54.1 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6116  hypothetical protein  54.1 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8596  hypothetical protein  54.1 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6738  hypothetical protein  47.54 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6170  hypothetical protein  48 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>