23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1098 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1098  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  0.172733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3495  hypothetical protein  61.11 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0544  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  58.17 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0740  hypothetical protein  57.41 
 
 		 200 aa  164  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0803739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0625  hypothetical protein  64.33 
 
 		 165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.378241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0494  hypothetical protein  58.45 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.690027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0331  hypothetical protein  53.85 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2682  hypothetical protein  54.49 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3738  hypothetical protein  58.87 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  0.0272563 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0628  hypothetical protein  54.29 
 
 		 216 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0799626  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0633  hypothetical protein  54.29 
 
 		 216 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0836071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2650  hypothetical protein  50 
 
 		 274 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384111  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0599  hypothetical protein  51.03 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1625  putative signal peptide  41.95 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.104398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1692  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  44.71 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7624  hypothetical protein  70.59 
 
 		 128 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2733  hypothetical protein  56.18 
 
 		 135 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074357  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8807  hypothetical protein  57.97 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6116  hypothetical protein  57.97 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0759  hypothetical protein  58.82 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8596  hypothetical protein  56.52 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6738  hypothetical protein  60.66 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6170  hypothetical protein  53.7 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>