23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1625 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1625  putative signal peptide  100 
 
 
199 aa  400  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.104398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0494  hypothetical protein  46.67 
 
 
168 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.690027  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1692  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.19 
 
 
181 aa  121  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0544  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  45.45 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3495  hypothetical protein  46.77 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0625  hypothetical protein  44.17 
 
 
165 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.378241  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1098  hypothetical protein  44.97 
 
 
163 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  0.172733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0331  hypothetical protein  41.07 
 
 
169 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.740068  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0628  hypothetical protein  37.93 
 
 
216 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0799626  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0633  hypothetical protein  37.93 
 
 
216 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0836071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2682  hypothetical protein  38.98 
 
 
161 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0740  hypothetical protein  41.82 
 
 
200 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0803739  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2650  hypothetical protein  38.64 
 
 
274 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384111  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0599  hypothetical protein  74.58 
 
 
166 aa  97.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7624  hypothetical protein  68.66 
 
 
128 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3738  hypothetical protein  41.76 
 
 
152 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  0.0272563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2733  hypothetical protein  58.44 
 
 
135 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0759  hypothetical protein  57.32 
 
 
134 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8807  hypothetical protein  59.09 
 
 
112 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6116  hypothetical protein  59.09 
 
 
112 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8596  hypothetical protein  62.12 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6738  hypothetical protein  54.84 
 
 
138 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6170  hypothetical protein  49.37 
 
 
113 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>