23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1692 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1692  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 
181 aa  351  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1625  putative signal peptide  50.91 
 
 
199 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.104398 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0628  hypothetical protein  45.75 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0799626  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0633  hypothetical protein  45.75 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0836071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0544  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.28 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3495  hypothetical protein  49.11 
 
 
157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0494  hypothetical protein  46.58 
 
 
168 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.690027  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2682  hypothetical protein  48.25 
 
 
161 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0331  hypothetical protein  40.59 
 
 
169 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.740068  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1098  hypothetical protein  46.53 
 
 
163 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  0.172733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2650  hypothetical protein  36.31 
 
 
274 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3738  hypothetical protein  49.32 
 
 
152 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  0.0272563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0625  hypothetical protein  46.11 
 
 
165 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.378241  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0740  hypothetical protein  44.38 
 
 
200 aa  99  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0803739  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0599  hypothetical protein  47.89 
 
 
166 aa  95.5  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7624  hypothetical protein  67.57 
 
 
128 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2733  hypothetical protein  63.33 
 
 
135 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0759  hypothetical protein  56.47 
 
 
134 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8807  hypothetical protein  56.41 
 
 
112 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6116  hypothetical protein  56.41 
 
 
112 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8596  hypothetical protein  57.69 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6170  hypothetical protein  59.26 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6738  hypothetical protein  60.66 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>