23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7624 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7624  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  248  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0759  hypothetical protein  69.4 
 
 
134 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2733  hypothetical protein  83.33 
 
 
135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6738  hypothetical protein  72.46 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8596  hypothetical protein  66.41 
 
 
112 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6116  hypothetical protein  62.5 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8807  hypothetical protein  62.5 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3495  hypothetical protein  75.41 
 
 
157 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0740  hypothetical protein  69.84 
 
 
200 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0803739  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1098  hypothetical protein  70 
 
 
163 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  0.172733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0599  hypothetical protein  68.85 
 
 
166 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1692  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  71.19 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1625  putative signal peptide  67.8 
 
 
199 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.104398 
 
 
-
 
NC_004310  BR0633  hypothetical protein  60.87 
 
 
216 aa  87  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0836071  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0628  hypothetical protein  60.87 
 
 
216 aa  87  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0799626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3738  hypothetical protein  67.8 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  0.0272563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2650  hypothetical protein  59.42 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2682  hypothetical protein  60.94 
 
 
161 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0331  hypothetical protein  61.02 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.740068  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0625  hypothetical protein  56.67 
 
 
165 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.378241  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0544  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  53.26 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0494  hypothetical protein  48.28 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.690027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6170  hypothetical protein  58.18 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>