23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0494 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0494  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.690027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0544  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  68.75 
 
 		 175 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0331  hypothetical protein  65.88 
 
 		 169 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0625  hypothetical protein  62.35 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.378241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3495  hypothetical protein  53.7 
 
 		 157 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1098  hypothetical protein  51.45 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  0.172733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2682  hypothetical protein  46.1 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0740  hypothetical protein  46.63 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0803739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0628  hypothetical protein  47.18 
 
 		 216 aa  121  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0799626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3738  hypothetical protein  46.95 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  0.0272563 
 
 
-
 
NC_004310  BR0633  hypothetical protein  47.18 
 
 		 216 aa  121  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0836071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2650  hypothetical protein  44.97 
 
 		 274 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384111  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1625  putative signal peptide  35.36 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.104398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1692  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  36.9 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0599  hypothetical protein  37.68 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2733  hypothetical protein  49.35 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7624  hypothetical protein  57.38 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0759  hypothetical protein  54.55 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8807  hypothetical protein  53.25 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6116  hypothetical protein  53.25 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8596  hypothetical protein  48.05 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6170  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6738  hypothetical protein  44.26 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>