More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3107 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3107  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 463 aa  928    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  36.24 
 
 		 494 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  36.3 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  36.75 
 
 		 469 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  36.7 
 
 		 475 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  35.84 
 
 		 475 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2500  aldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  37.06 
 
 		 477 aa  280  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 		 468 aa  276  4e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  34.37 
 
 		 484 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  35.43 
 
 		 475 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  35.7 
 
 		 475 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0611  aldehyde dehydrogenase  39.22 
 
 		 478 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  35.11 
 
 		 479 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  38.01 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  32.01 
 
 		 477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  35.57 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  33.77 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  32.82 
 
 		 465 aa  267  4e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  35.35 
 
 		 472 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  38.64 
 
 		 473 aa  266  7e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  34.51 
 
 		 477 aa  266  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  33.11 
 
 		 466 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 476 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  37.93 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  34.69 
 
 		 496 aa  259  9e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  34.69 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  32.31 
 
 		 474 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2296  Aldehyde Dehydrogenase  39.56 
 
 		 479 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  32.82 
 
 		 474 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  32.6 
 
 		 474 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  32.38 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  32.82 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  32.82 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  32.82 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  32.05 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0327  Aldehyde Dehydrogenase  36.01 
 
 		 491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3490  aldehyde dehydrogenase  37.35 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  32.38 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0762  aldehyde dehydrogenase  34.87 
 
 		 475 aa  254  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.338463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6531  aldehyde dehydrogenase  35.09 
 
 		 481 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0162128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  32.16 
 
 		 474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  34.3 
 
 		 485 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  32.16 
 
 		 474 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  33.49 
 
 		 484 aa  253  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  34.97 
 
 		 506 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  31.97 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  33.63 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1622  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.75 
 
 		 478 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.95 
 
 		 477 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  34.95 
 
 		 479 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  33.83 
 
 		 478 aa  249  6e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.72 
 
 		 479 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.72 
 
 		 479 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1391  aldehyde dehydrogenase  35.9 
 
 		 477 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0213  aldehyde dehydrogenase  35.9 
 
 		 477 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0247  aldehyde dehydrogenase  35.9 
 
 		 477 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1588  aldehyde dehydrogenase  35.9 
 
 		 477 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  34.72 
 
 		 479 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.72 
 
 		 479 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0973  aldehyde dehydrogenase  35.9 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2695  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.9 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2549  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.9 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.18 
 
 		 482 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.72 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.72 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.57 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0744  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  34.93 
 
 		 496 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0497509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  30.75 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4339  Aldehyde Dehydrogenase  39.8 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0638  aldehyde dehydrogenase  33.19 
 
 		 477 aa  246  6e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00666091  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.49 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  33.85 
 
 		 465 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  34.71 
 
 		 479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  32.31 
 
 		 472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.49 
 
 		 479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  33.7 
 
 		 479 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  35.75 
 
 		 479 aa  243  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1097  aldehyde dehydrogenase  34.51 
 
 		 490 aa  242  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7826  Aldehyde Dehydrogenase  35.08 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1037  aldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.030007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  33.79 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3849  aldehyde dehydrogenase  34.17 
 
 		 476 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0897  aldehyde dehydrogenase  36.72 
 
 		 479 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0403101 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8568  Aldehyde Dehydrogenase  35.11 
 
 		 484 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2311  aldehyde dehydrogenase  33.49 
 
 		 477 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3221  aldehyde dehydrogenase  34.5 
 
 		 488 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2378  aldehyde dehydrogenase  32.75 
 
 		 478 aa  239  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00657  Aldehyde dehydrogenase  33.66 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5510  aldehyde dehydrogenase  33.49 
 
 		 477 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2498  putative aldehyde dehydrogenase  36.28 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1899  aldehyde dehydrogenase  31.99 
 
 		 471 aa  237  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4973  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  33.63 
 
 		 484 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000556305  normal  0.433203 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3783  aldehyde dehydrogenase  33.09 
 
 		 477 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  0.465588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4580  aldehyde dehydrogenase  33.09 
 
 		 477 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204426  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  36.62 
 
 		 508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3740  aldehyde dehydrogenase  33.09 
 
 		 477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0498  aldehyde dehydrogenase  34.94 
 
 		 477 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>