15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5010 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_5010  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5456  hypothetical protein  89.97 
 
 
309 aa  554  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0127  hypothetical protein  77.6 
 
 
309 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2110  hypothetical protein  74.76 
 
 
309 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4974  hypothetical protein  50.83 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0948884  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3186  hypothetical protein  50.83 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.934686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4293  hypothetical protein  50.83 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151763  normal  0.378541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3703  hypothetical protein  34.84 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1211  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0688  hypothetical protein  26.26 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2413  hypothetical protein  26.26 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0779  hypothetical protein  26.26 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1136  hypothetical protein  26.26 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1743  hypothetical protein  26.26 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5356  hypothetical protein  22.02 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>