18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5356 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5356  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3703  hypothetical protein  23.43 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4293  hypothetical protein  26.27 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151763  normal  0.378541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4974  hypothetical protein  26.27 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0948884  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3186  hypothetical protein  26.27 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.934686 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0688  hypothetical protein  24.5 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1743  hypothetical protein  24.5 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1136  hypothetical protein  24.5 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0779  hypothetical protein  24.5 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2413  hypothetical protein  24.5 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1211  hypothetical protein  24.5 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2694  hypothetical protein  22.45 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2110  hypothetical protein  22.22 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5010  hypothetical protein  22.38 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6147  hypothetical protein  22.5 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.600934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0127  hypothetical protein  21.7 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3713  hypothetical protein  24.79 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5456  hypothetical protein  21.23 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>