95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1221 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1221  DsrC-like protein  100 
 
 		 118 aa  242  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000524568  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1171  putative DsrC-like protein  90.29 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000253263  hitchhiker  0.000489531 
 
 
 
NC_009524  PsycPRwf_0974  DsrC family protein  63.39 
 
 		 128 aa  153  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000106155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3171  DsrC-like protein  40 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169026  normal  0.259405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1922  DsrC-like protein  43.56 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.692492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28150  dissimilatory sulfite reductase, DsrC-like protein  39.6 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3400  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  41.58 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.340087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02107  sulfite reductase, gamma subunit-related protein  35.35 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00973247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003411  tRNA 2-thiouridine synthesizing protein E  36.36 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30370  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1705  hypothetical protein  37.37 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.826446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1159  sulfur transfer protein TusE  33.33 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240389  normal  0.524036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2600  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1125  sulfur transfer protein TusE  33.33 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.84282e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1193  sulfur transfer protein TusE  33.33 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1147  sulfur transfer protein TusE  33.33 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02366  hypothetical protein  35.35 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1481  sulfur transfer protein TusE  33.33 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0185238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2847  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  35.64 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3996  hypothetical protein  38.61 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546162  hitchhiker  0.00513548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3341  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184843  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1471  sulfur oxidation protein of DsrC family protein  32.32 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1042  sulfur transfer protein TusE  32.32 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2687  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  34.34 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3578  DsrC-like protein  40 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3250  DsrC family protein  36 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120353  hitchhiker  0.0000159534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1837  DsrC family protein  37.62 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00019972 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0329  sulfite reductase-like protein  33.33 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000011498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2618  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  35.35 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00973  predicted sulfite reductase subunit  31.31 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0364521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1334  intracellular sulfur oxidation protein DsrC  35 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2529  sulfurtransferase TusE  35.35 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.248983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00980  hypothetical protein  31.31 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2346  putative sulfur oxidation protein DsrC  32.32 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.691192  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2538  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  34.34 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.023632  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3211  sulfurtransferase TusE  35.35 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155098  hitchhiker  0.00231133 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2379  desulfoviridin subunit gamma  33.02 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2627  sulfur transfer protein TusE  31.31 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586166  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1220  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  34.34 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1133  sulfur transfer protein TusE  31.31 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1083  sulfur transfer protein TusE  31.31 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000029188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1077  sulfur transfer protein TusE  31.31 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00172149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2347  sulfur transfer protein TusE  31.31 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2674  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  31.31 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000927643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2455  DsrC-like protein  32 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000476368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2150  sulfur transfer protein TusE  31.31 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2380  DsrC family protein  40.59 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475573  normal  0.0210975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3601  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  40.59 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0970  sulfite reductase, gamma subunit  34.34 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000838427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2480  putative sulfite reductase  32 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.295846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0035  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  32.67 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1858  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  33 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000483369  normal  0.0744764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1766  DsrC family protein  33.33 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000239637  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1805  DsrC-like protein  34 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0038276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1956  DsrC family protein  30.3 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1800  DsrC family protein  33.33 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0554138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2107  DsrC family protein  32.32 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1969  DsrC family protein  31.13 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270219  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0413  dissimilatory sulfite reductase, gamma subunit  31.13 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1778  DsrC-like protein  30 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204977  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2056  formate dehydrogenase  31.13 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0328837  hitchhiker  0.0003026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1658  DsrC family protein  29.29 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2317  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  33.02 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2162  DsrC family protein  33.02 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000107073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2197  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  33.02 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304375  normal  0.208546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2209  DsrC family protein  33.02 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2132  DsrC family protein  32.32 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0500463  normal  0.0142953 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2007  DsrC family protein  30.19 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2018  DsrC family protein  31.31 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000134118  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0048  DsrC family protein  30.3 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2190  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.3 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.277323  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2005  DsrC family protein  33.33 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0035  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  30.56 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000508845  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2477  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  31.31 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3197  DsrC family protein  32.67 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0261  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.84 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  28.97 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595568 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0856  DsrC family protein  31.48 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1522  DsrC family protein  30 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0907528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0693  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.69 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2190  DsrC family protein  29.7 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1632  DsrC-like protein  26.73 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0127  DsrC family protein  26.85 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1957  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  26 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000351468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2322  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  26.17 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1536  DsrC family protein  30.69 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  29.47 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.475265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0028  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  24.3 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.46834  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0365  DsrC -like protein  27 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0997  DsrC family protein  27.93 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.906471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2658  DsrC -like protein  28.97 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0635  DsrC-like protein  28.87 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218073  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2131  putative dissimilatory sulfite reductase  28.16 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4045  DsrC family protein  25 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000373929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2958  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  25.74 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>