121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2018 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2018  DsrC family protein  100 
 
 		 107 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000134118  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2132  DsrC family protein  81.13 
 
 		 111 aa  184  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0500463  normal  0.0142953 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2477  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  81.13 
 
 		 115 aa  183  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2107  DsrC family protein  77.36 
 
 		 109 aa  173  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1969  DsrC family protein  73.83 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270219  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1800  DsrC family protein  74.53 
 
 		 112 aa  172  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0554138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1805  DsrC-like protein  74.53 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0038276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2379  desulfoviridin subunit gamma  74.77 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2056  formate dehydrogenase  73.83 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0328837  hitchhiker  0.0003026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2007  DsrC family protein  72.9 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2162  DsrC family protein  72.64 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000107073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2209  DsrC family protein  72.64 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2317  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  72.64 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2197  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  72.64 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304375  normal  0.208546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1778  DsrC-like protein  71.03 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204977  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1766  DsrC family protein  73.58 
 
 		 109 aa  163  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000239637  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1220  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  69.16 
 
 		 109 aa  156  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00973  predicted sulfite reductase subunit  68.22 
 
 		 109 aa  156  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0364521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00980  hypothetical protein  68.22 
 
 		 109 aa  156  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2529  sulfurtransferase TusE  74.26 
 
 		 109 aa  156  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.248983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2618  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  74.26 
 
 		 109 aa  156  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2005  DsrC family protein  75.47 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2687  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  73.27 
 
 		 109 aa  155  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3211  sulfurtransferase TusE  75.25 
 
 		 109 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155098  hitchhiker  0.00231133 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2674  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  68.22 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000927643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1077  sulfur transfer protein TusE  68.22 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00172149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1083  sulfur transfer protein TusE  68.22 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000029188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2627  sulfur transfer protein TusE  68.22 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586166  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2347  sulfur transfer protein TusE  68.22 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1125  sulfur transfer protein TusE  67.29 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.84282e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1193  sulfur transfer protein TusE  67.29 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1147  sulfur transfer protein TusE  67.29 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1042  sulfur transfer protein TusE  67.29 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1159  sulfur transfer protein TusE  67.29 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240389  normal  0.524036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1133  sulfur transfer protein TusE  68.22 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1481  sulfur transfer protein TusE  71.57 
 
 		 109 aa  154  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0185238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2150  sulfur transfer protein TusE  68.22 
 
 		 109 aa  154  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2455  DsrC-like protein  67.92 
 
 		 114 aa  153  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000476368  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0329  sulfite reductase-like protein  63.73 
 
 		 109 aa  150  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000011498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2847  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  70.3 
 
 		 109 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2538  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  70.3 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.023632  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02366  hypothetical protein  65.42 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1705  hypothetical protein  66.04 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.826446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003411  tRNA 2-thiouridine synthesizing protein E  63.55 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0970  sulfite reductase, gamma subunit  65.09 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000838427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1471  sulfur oxidation protein of DsrC family protein  58.88 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02107  sulfite reductase, gamma subunit-related protein  63.21 
 
 		 115 aa  140  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00973247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2480  putative sulfite reductase  59.8 
 
 		 111 aa  140  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.295846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1658  DsrC family protein  58.25 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0048  DsrC family protein  58.59 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0413  dissimilatory sulfite reductase, gamma subunit  57.14 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1956  DsrC family protein  56.31 
 
 		 110 aa  133  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2346  putative sulfur oxidation protein DsrC  56.6 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.691192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2190  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  57.58 
 
 		 110 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.277323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3250  DsrC family protein  57.69 
 
 		 106 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120353  hitchhiker  0.0000159534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2600  hypothetical protein  51.96 
 
 		 111 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2658  DsrC -like protein  47.52 
 
 		 110 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1922  DsrC-like protein  50.98 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.692492  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0693  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  52 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30370  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1957  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  47.17 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000351468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0127  DsrC family protein  51 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3341  hypothetical protein  51.4 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1837  DsrC family protein  51.43 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00019972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28150  dissimilatory sulfite reductase, DsrC-like protein  51.02 
 
 		 111 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1858  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  50 
 
 		 111 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000483369  normal  0.0744764 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2322  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  50 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0035  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  49.02 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000508845  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3996  hypothetical protein  50.48 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546162  hitchhiker  0.00513548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3171  DsrC-like protein  51.49 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169026  normal  0.259405 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0028  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  47 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.46834  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0997  DsrC family protein  45.45 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.906471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1522  DsrC family protein  49.48 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0907528  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3400  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  51.43 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.340087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3601  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  50.48 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347433 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1334  intracellular sulfur oxidation protein DsrC  47.92 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3578  DsrC-like protein  49.52 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2181  DsrC family protein  42 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2380  DsrC family protein  48.04 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475573  normal  0.0210975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0261  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  39.39 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1632  DsrC-like protein  39.81 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  40.4 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595568 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0035  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  43.27 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0365  DsrC -like protein  42.11 
 
 		 111 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4045  DsrC family protein  39.81 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000373929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3197  DsrC family protein  41.35 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2327  putative sulfite reductase  40.43 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1408  sulfite reductase gamma chain  37 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2326  putative sulfite reductase  35.92 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.440436 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0856  DsrC family protein  37.17 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2958  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  39.39 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1442  DsrC family protein  38 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.486208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1536  DsrC family protein  38.46 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2561  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  38.24 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000243297  hitchhiker  0.0080986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2190  DsrC family protein  39.81 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1196  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  36.45 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270848 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1917  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  36.45 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.512017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0463  DsrC family protein  39 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223057  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1227  DsrC family protein  35 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.214898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0910  DsrC family protein  36 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>