123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1083 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2674  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  100 
 
 
109 aa  225  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000927643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1077  sulfur transfer protein TusE  100 
 
 
109 aa  225  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00172149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1083  sulfur transfer protein TusE  100 
 
 
109 aa  225  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000029188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2627  sulfur transfer protein TusE  100 
 
 
109 aa  225  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586166  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2347  sulfur transfer protein TusE  100 
 
 
109 aa  225  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1133  sulfur transfer protein TusE  100 
 
 
109 aa  225  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2150  sulfur transfer protein TusE  99.08 
 
 
109 aa  224  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal  0.484844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00973  predicted sulfite reductase subunit  99.08 
 
 
109 aa  223  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0364521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00980  hypothetical protein  99.08 
 
 
109 aa  223  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1481  sulfur transfer protein TusE  91.74 
 
 
109 aa  208  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0185238  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1125  sulfur transfer protein TusE  90.83 
 
 
109 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.84282e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1193  sulfur transfer protein TusE  90.83 
 
 
109 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1147  sulfur transfer protein TusE  90.83 
 
 
109 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1042  sulfur transfer protein TusE  90.83 
 
 
109 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1159  sulfur transfer protein TusE  90.83 
 
 
109 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240389  normal  0.524036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1220  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  78.9 
 
 
109 aa  186  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2529  sulfurtransferase TusE  80.73 
 
 
109 aa  184  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.248983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2618  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  80.73 
 
 
109 aa  184  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2847  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  77.98 
 
 
109 aa  183  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2538  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  79.82 
 
 
109 aa  183  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.023632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2687  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  78.9 
 
 
109 aa  183  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3211  sulfurtransferase TusE  78.9 
 
 
109 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155098  hitchhiker  0.00231133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1766  DsrC family protein  77.06 
 
 
109 aa  178  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000239637  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2132  DsrC family protein  67.92 
 
 
111 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0500463  normal  0.0142953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1800  DsrC family protein  65.09 
 
 
112 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0554138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2107  DsrC family protein  69.72 
 
 
109 aa  157  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1778  DsrC-like protein  66.67 
 
 
112 aa  156  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204977  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2018  DsrC family protein  68.22 
 
 
107 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000134118  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1471  sulfur oxidation protein of DsrC family protein  62.04 
 
 
108 aa  154  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003411  tRNA 2-thiouridine synthesizing protein E  63.3 
 
 
109 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0970  sulfite reductase, gamma subunit  64.22 
 
 
109 aa  151  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000838427  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02366  hypothetical protein  63.3 
 
 
109 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0329  sulfite reductase-like protein  59.63 
 
 
109 aa  150  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000011498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2477  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  66.04 
 
 
115 aa  150  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1805  DsrC-like protein  63.21 
 
 
112 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0038276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2056  formate dehydrogenase  64.81 
 
 
112 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0328837  hitchhiker  0.0003026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1969  DsrC family protein  63.89 
 
 
112 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270219  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2162  DsrC family protein  62.96 
 
 
112 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000107073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2209  DsrC family protein  62.96 
 
 
112 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2317  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  62.96 
 
 
112 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000269455  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2197  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  62.96 
 
 
112 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304375  normal  0.208546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2379  desulfoviridin subunit gamma  62.96 
 
 
112 aa  148  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2007  DsrC family protein  63.89 
 
 
112 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02107  sulfite reductase, gamma subunit-related protein  66.04 
 
 
115 aa  147  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00973247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2455  DsrC-like protein  65.09 
 
 
114 aa  147  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000476368  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0413  dissimilatory sulfite reductase, gamma subunit  62.75 
 
 
163 aa  142  1e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2346  putative sulfur oxidation protein DsrC  59.63 
 
 
112 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.691192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1705  hypothetical protein  62.26 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.826446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2005  DsrC family protein  63.89 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2480  putative sulfite reductase  55.96 
 
 
111 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.295846  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0048  DsrC family protein  50.94 
 
 
111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000243579  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1658  DsrC family protein  52.88 
 
 
110 aa  127  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2190  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  52.88 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.277323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1956  DsrC family protein  50 
 
 
110 aa  122  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3341  hypothetical protein  52.78 
 
 
111 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30370  hypothetical protein  47.71 
 
 
111 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1922  DsrC-like protein  49.07 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.692492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3171  DsrC-like protein  50.93 
 
 
111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169026  normal  0.259405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28150  dissimilatory sulfite reductase, DsrC-like protein  50 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0693  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  50.48 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113713  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2322  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  48.6 
 
 
111 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2600  hypothetical protein  45.87 
 
 
111 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1334  intracellular sulfur oxidation protein DsrC  50.52 
 
 
107 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0035  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  45.87 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000508845  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0127  DsrC family protein  45.87 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0028  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  47.62 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.46834  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1858  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  46.67 
 
 
111 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000483369  normal  0.0744764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3250  DsrC family protein  51.02 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120353  hitchhiker  0.0000159534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3996  hypothetical protein  49.5 
 
 
111 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546162  hitchhiker  0.00513548 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2658  DsrC -like protein  44.23 
 
 
110 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1957  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  47.62 
 
 
111 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000351468  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1837  DsrC family protein  47.22 
 
 
111 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00019972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3400  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  47.22 
 
 
111 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.340087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3578  DsrC-like protein  50 
 
 
111 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2380  DsrC family protein  50.96 
 
 
111 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475573  normal  0.0210975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1522  DsrC family protein  45.45 
 
 
108 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0907528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3601  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  48.15 
 
 
111 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.347433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0997  DsrC family protein  42.27 
 
 
118 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.906471  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1632  DsrC-like protein  40.57 
 
 
105 aa  93.6  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  40 
 
 
105 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0261  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  37.61 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2181  DsrC family protein  40.38 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0365  DsrC -like protein  40.19 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4045  DsrC family protein  37.38 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000373929  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2326  putative sulfite reductase  38.78 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.440436 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3197  DsrC family protein  37.14 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0035  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  40 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1408  sulfite reductase gamma chain  39.58 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57748  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3037  DsrC family protein  37.74 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0059771  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2190  DsrC family protein  39.62 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0856  DsrC family protein  36.61 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2327  putative sulfite reductase  39.58 
 
 
111 aa  83.6  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1196  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  35.78 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0534  DsrC family protein  36.7 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2958  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  36.36 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1739  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  36.45 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0853  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  39.81 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000299223  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1917  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  34.86 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.512017  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1227  DsrC family protein  37.38 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.214898  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0974  DsrC family protein  34.34 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000106155 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>