123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2322 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2322  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  100 
 
 
111 aa  231  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301643  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1957  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  83.78 
 
 
111 aa  196  9e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000351468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0693  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  82.88 
 
 
111 aa  196  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0127  DsrC family protein  81.98 
 
 
111 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0035  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  80.18 
 
 
111 aa  189  8e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000508845  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0028  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  76.58 
 
 
111 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.46834  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1858  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  72.97 
 
 
111 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000483369  normal  0.0744764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0048  DsrC family protein  59.63 
 
 
111 aa  141  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000243579  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1658  DsrC family protein  55.86 
 
 
110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2190  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  59.46 
 
 
110 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.277323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1956  DsrC family protein  54.05 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2480  putative sulfite reductase  57.43 
 
 
111 aa  127  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.295846  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2529  sulfurtransferase TusE  51.38 
 
 
109 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.248983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3211  sulfurtransferase TusE  51.38 
 
 
109 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155098  hitchhiker  0.00231133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2618  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  51.38 
 
 
109 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2538  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  50.46 
 
 
109 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.023632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1800  DsrC family protein  50.46 
 
 
112 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0554138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2477  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  49.09 
 
 
115 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1766  DsrC family protein  50.46 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000239637  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1778  DsrC-like protein  50 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204977  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1969  DsrC family protein  49.53 
 
 
112 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270219  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2056  formate dehydrogenase  50.47 
 
 
112 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0328837  hitchhiker  0.0003026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2007  DsrC family protein  49.53 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2847  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  48.62 
 
 
109 aa  115  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1805  DsrC-like protein  47.71 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0038276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2107  DsrC family protein  44.95 
 
 
109 aa  114  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2379  desulfoviridin subunit gamma  48.6 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2687  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  47.71 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1471  sulfur oxidation protein of DsrC family protein  45.79 
 
 
108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00973  predicted sulfite reductase subunit  48.6 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0364521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0261  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  51.4 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00980  hypothetical protein  48.6 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1481  sulfur transfer protein TusE  47.71 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0185238  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2132  DsrC family protein  45.45 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0500463  normal  0.0142953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1220  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  48.6 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2674  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  48.6 
 
 
109 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000927643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1077  sulfur transfer protein TusE  48.6 
 
 
109 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00172149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1083  sulfur transfer protein TusE  48.6 
 
 
109 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000029188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2627  sulfur transfer protein TusE  48.6 
 
 
109 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586166  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2347  sulfur transfer protein TusE  48.6 
 
 
109 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1133  sulfur transfer protein TusE  48.6 
 
 
109 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1705  hypothetical protein  46.79 
 
 
108 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.826446  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2162  DsrC family protein  46.79 
 
 
112 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000107073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2209  DsrC family protein  46.79 
 
 
112 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2317  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  46.79 
 
 
112 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000269455  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2150  sulfur transfer protein TusE  48.6 
 
 
109 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2197  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  46.79 
 
 
112 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304375  normal  0.208546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2455  DsrC-like protein  46.79 
 
 
114 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000476368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2346  putative sulfur oxidation protein DsrC  44.04 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.691192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2018  DsrC family protein  50 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000134118  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0970  sulfite reductase, gamma subunit  43.12 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000838427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  47.75 
 
 
105 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1042  sulfur transfer protein TusE  46.73 
 
 
109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1125  sulfur transfer protein TusE  46.73 
 
 
109 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.84282e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1193  sulfur transfer protein TusE  46.73 
 
 
109 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1147  sulfur transfer protein TusE  46.73 
 
 
109 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1159  sulfur transfer protein TusE  46.73 
 
 
109 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240389  normal  0.524036 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0329  sulfite reductase-like protein  43.12 
 
 
109 aa  107  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000011498  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0413  dissimilatory sulfite reductase, gamma subunit  40.54 
 
 
163 aa  103  7e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3197  DsrC family protein  47.27 
 
 
105 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4045  DsrC family protein  44.55 
 
 
105 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000373929  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02366  hypothetical protein  43.93 
 
 
109 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02107  sulfite reductase, gamma subunit-related protein  46 
 
 
115 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00973247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2005  DsrC family protein  47.71 
 
 
112 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003411  tRNA 2-thiouridine synthesizing protein E  42.06 
 
 
109 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1632  DsrC-like protein  44.55 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2658  DsrC -like protein  42.34 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2958  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  44.55 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3250  DsrC family protein  43.43 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120353  hitchhiker  0.0000159534 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1196  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  42.73 
 
 
105 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1739  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  42.73 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0035  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  44.55 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0762  dissimilatory sulfite reductase, gamma subunit  41.82 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28150  dissimilatory sulfite reductase, DsrC-like protein  44.44 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1837  DsrC family protein  45.45 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00019972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0534  DsrC family protein  40.91 
 
 
105 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3996  hypothetical protein  44.44 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546162  hitchhiker  0.00513548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30370  hypothetical protein  42.2 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2600  hypothetical protein  41.28 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1917  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  43.64 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.512017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1334  intracellular sulfur oxidation protein DsrC  42.27 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2181  DsrC family protein  39.25 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350522  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0463  DsrC family protein  40 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1408  sulfite reductase gamma chain  41.41 
 
 
106 aa  87  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57748  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0856  DsrC family protein  37.61 
 
 
114 aa  87  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3400  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  41.41 
 
 
111 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.340087 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1227  DsrC family protein  43.56 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.214898  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2327  putative sulfite reductase  39.81 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3341  hypothetical protein  41.28 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184843  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1442  DsrC family protein  42.57 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.486208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3171  DsrC-like protein  39.45 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169026  normal  0.259405 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0910  DsrC family protein  40.74 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2190  DsrC family protein  40.91 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0168  DsrC family protein  44.55 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0347  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  44.55 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0220542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0997  DsrC family protein  39.8 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.906471  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1522  DsrC family protein  36.36 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0907528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  38.32 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.475265  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3601  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  44.44 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.347433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3578  DsrC-like protein  42.57 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>