15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4827 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4827  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4773  hypothetical protein  97.84 
 
 		 160 aa  273  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4649  hypothetical protein  97.12 
 
 		 139 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.560505  normal  0.168471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0647  hypothetical protein  87.05 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4789  hypothetical protein  71.22 
 
 		 139 aa  216  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4332  hypothetical protein  71.94 
 
 		 139 aa  216  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4936  hypothetical protein  71.94 
 
 		 139 aa  215  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3740  hypothetical protein  69.06 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12620  hypothetical protein  66.91 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1147  hypothetical protein  65.47 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09980  hypothetical protein  53.24 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.229302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2793  hypothetical protein  45.54 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0772673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2137  hypothetical protein  43.31 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2742  hypothetical protein  41.44 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.60217e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3890  hypothetical protein  36.61 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.849324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>