15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3890 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3890  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  309  9e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.849324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2793  hypothetical protein  67.21 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0772673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12620  hypothetical protein  43.69 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1147  hypothetical protein  44.66 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09980  hypothetical protein  41.32 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.229302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4936  hypothetical protein  39.29 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2137  hypothetical protein  38.06 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2742  hypothetical protein  37.29 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.60217e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0647  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4773  hypothetical protein  36.61 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4649  hypothetical protein  36.61 
 
 		 139 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.560505  normal  0.168471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4827  hypothetical protein  36.61 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3740  hypothetical protein  38.83 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4332  hypothetical protein  36.61 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4789  hypothetical protein  36.61 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>