15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1147 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1147  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  273  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12620  hypothetical protein  98.55 
 
 
138 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40597  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0647  hypothetical protein  68.35 
 
 
139 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309841  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4773  hypothetical protein  64.75 
 
 
160 aa  186  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4649  hypothetical protein  64.75 
 
 
139 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.560505  normal  0.168471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4827  hypothetical protein  65.47 
 
 
139 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3740  hypothetical protein  63.31 
 
 
139 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4936  hypothetical protein  64.75 
 
 
139 aa  184  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4332  hypothetical protein  62.59 
 
 
139 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4789  hypothetical protein  61.87 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09980  hypothetical protein  56.12 
 
 
139 aa  160  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.229302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2793  hypothetical protein  44.64 
 
 
154 aa  103  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0772673  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2742  hypothetical protein  39.13 
 
 
150 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.60217e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2137  hypothetical protein  46.08 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3890  hypothetical protein  44.66 
 
 
153 aa  90.5  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.849324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>