15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4789 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4789  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  276  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4332  hypothetical protein  97.84 
 
 		 139 aa  272  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4936  hypothetical protein  78.42 
 
 		 139 aa  225  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4773  hypothetical protein  70.5 
 
 		 160 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4827  hypothetical protein  71.22 
 
 		 139 aa  216  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4649  hypothetical protein  69.78 
 
 		 139 aa  215  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.560505  normal  0.168471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0647  hypothetical protein  70.5 
 
 		 139 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3740  hypothetical protein  61.87 
 
 		 139 aa  184  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12620  hypothetical protein  63.31 
 
 		 138 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1147  hypothetical protein  61.87 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09980  hypothetical protein  54.68 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.229302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2793  hypothetical protein  39.69 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0772673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2137  hypothetical protein  39.29 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2742  hypothetical protein  40.54 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.60217e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3890  hypothetical protein  36.61 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.849324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>