15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2572 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2572  bacteriochlorophyll C binding protein  100 
 
 		 80 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000646673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0265  chlorosome envelope protein A  97.5 
 
 		 80 aa  157  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000105111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0219  chlorosome envelope protein A  97.5 
 
 		 80 aa  157  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.540959  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2145  bacteriochlorophyll C binding protein  93.75 
 
 		 80 aa  134  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0310736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1960  bacteriochlorophyll C binding protein  90.12 
 
 		 81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2299  bacteriochlorophyll C binding protein  88.89 
 
 		 81 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000633498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2195  bacteriochlorophyll C binding protein  82.72 
 
 		 81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574411 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0231  bacteriochlorophyll C binding protein  50 
 
 		 83 aa  76.6  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2013  chlorosome envelope protein E  47.5 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.41812 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0260  bacteriochlorophyll C binding protein  44.3 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0250  chlorosome envelope protein E  50.62 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0939  chlorosome envelope protein E  48.72 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.414323 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2359  bacteriochlorophyll C binding protein  46.25 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.25226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2542  bacteriochlorophyll C binding protein  41.25 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0207  bacteriochlorophyll C binding protein  42.86 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>