15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2195 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2195  bacteriochlorophyll C binding protein  100 
 
 		 81 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574411 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0265  chlorosome envelope protein A  85.19 
 
 		 80 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000105111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0219  chlorosome envelope protein A  85.19 
 
 		 80 aa  135  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.540959  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2572  bacteriochlorophyll C binding protein  83.95 
 
 		 80 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000646673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2299  bacteriochlorophyll C binding protein  92.59 
 
 		 81 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000633498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1960  bacteriochlorophyll C binding protein  90.12 
 
 		 81 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2145  bacteriochlorophyll C binding protein  87.65 
 
 		 80 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0310736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0231  bacteriochlorophyll C binding protein  48.68 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0939  chlorosome envelope protein E  48.72 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.414323 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2359  bacteriochlorophyll C binding protein  47.44 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.25226  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0260  bacteriochlorophyll C binding protein  43.75 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2013  chlorosome envelope protein E  46.15 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.41812 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0250  chlorosome envelope protein E  50.63 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2542  bacteriochlorophyll C binding protein  43.59 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0207  bacteriochlorophyll C binding protein  40.26 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>