15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0231 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0231  bacteriochlorophyll C binding protein  100 
 
 		 83 aa  173  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2359  bacteriochlorophyll C binding protein  77.65 
 
 		 85 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.25226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2013  chlorosome envelope protein E  76.47 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.41812 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2542  bacteriochlorophyll C binding protein  69.41 
 
 		 85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0250  chlorosome envelope protein E  78.31 
 
 		 87 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0939  chlorosome envelope protein E  75.9 
 
 		 85 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.414323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0207  bacteriochlorophyll C binding protein  66.27 
 
 		 83 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0260  bacteriochlorophyll C binding protein  60.71 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0265  chlorosome envelope protein A  51.32 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000105111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0219  chlorosome envelope protein A  51.32 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.540959  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2572  bacteriochlorophyll C binding protein  50 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000646673  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2145  bacteriochlorophyll C binding protein  48.68 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0310736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2299  bacteriochlorophyll C binding protein  47.37 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000633498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1960  bacteriochlorophyll C binding protein  50 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2195  bacteriochlorophyll C binding protein  48.68 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>