15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0207 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0207  bacteriochlorophyll C binding protein  100 
 
 		 83 aa  174  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2542  bacteriochlorophyll C binding protein  71.08 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0231  bacteriochlorophyll C binding protein  66.27 
 
 		 83 aa  120  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2359  bacteriochlorophyll C binding protein  63.1 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.25226  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0260  bacteriochlorophyll C binding protein  62.65 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2013  chlorosome envelope protein E  59.52 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.41812 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0939  chlorosome envelope protein E  60.71 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.414323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0250  chlorosome envelope protein E  60.71 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0265  chlorosome envelope protein A  42.86 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000105111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0219  chlorosome envelope protein A  42.86 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.540959  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2572  bacteriochlorophyll C binding protein  42.86 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000646673  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2145  bacteriochlorophyll C binding protein  38.96 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0310736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1960  bacteriochlorophyll C binding protein  38.96 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2299  bacteriochlorophyll C binding protein  36.36 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000633498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2195  bacteriochlorophyll C binding protein  36.36 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>