35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2429 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  229  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  66.67 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2540  hypothetical protein  48.1 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  41.67 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  45.71 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  40.54 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  45.31 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1477  hypothetical protein  42.67 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  32.98 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  44.93 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  37.97 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  38.82 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  34.48 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  35.06 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  35.14 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  34.67 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1285  hypothetical protein  36.62 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1403  hypothetical protein  36.62 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  32.5 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  41.27 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0896  hypothetical protein  34.57 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89715  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0674  hypothetical protein  31.08 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  28.26 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  28.38 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1066  hypothetical protein  31.11 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  28.57 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1134  hypothetical protein  31.43 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  27.27 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  48.65 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  30 
 
 		 81 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1410  hypothetical protein  27.78 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.314119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0654  hypothetical protein  48.65 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.169854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>