33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0568 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  186  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  52.44 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  57.89 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  53.09 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  48.75 
 
 		 80 aa  94  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  53.33 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  44.29 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  39.44 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  40.28 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  43.94 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  38.89 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  37.18 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  33.33 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  35.06 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  32.47 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  35.71 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  43.08 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  36.25 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  43.08 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  37.31 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  34.38 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3398  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  30.68 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  30.26 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  31.65 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  38.33 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5000  hypothetical protein  32.39 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  35.21 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0617  hypothetical protein  29.85 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1449  hypothetical protein  28.21 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>