23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1097 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0896  hypothetical protein  48.72 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.558452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0617  hypothetical protein  45.57 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1181  hypothetical protein  42.67 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0897428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4366  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.825692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  32.86 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  25.97 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  30.38 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  31.51 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  37.31 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  36.49 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  35.21 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  32.89 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  35.14 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1285  hypothetical protein  29.23 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1403  hypothetical protein  29.23 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  30.67 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  34.21 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  30.86 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  29.87 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  30.99 
 
 		 89 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  30 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  40.38 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>