23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1285 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1285  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  205  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1403  hypothetical protein  98.99 
 
 
99 aa  204  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  47.52 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  55.56 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  49.18 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  47.89 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  38.89 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0906  hypothetical protein  38.96 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.866498  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0654  hypothetical protein  41.1 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.169854  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  43.55 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  36.62 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  30.14 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  38.03 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  36.62 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0896  hypothetical protein  32.89 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89715  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  34.62 
 
 
79 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  35.48 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  32.81 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  29.23 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3398  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  34.33 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  31.17 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0896  hypothetical protein  24.59 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.558452  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  27.71 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>