20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0654 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0654  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  204  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.169854  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  94.95 
 
 
117 aa  193  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  40 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  40 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1285  hypothetical protein  41.1 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1403  hypothetical protein  41.1 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  39.44 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1993  hypothetical protein  37.66 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558528  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0896  hypothetical protein  37.68 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89715  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  37.84 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  37.84 
 
 
91 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0906  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.866498  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  37.7 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1477  hypothetical protein  29.11 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  35.62 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  31.51 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  48.65 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  43.84 
 
 
79 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>