34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2500 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  178  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  75.31 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  71.43 
 
 		 79 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  51.39 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  45.21 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  48.61 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  47.89 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  41.89 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  39.44 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  40.54 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  35.96 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  37.84 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  42.25 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  37.66 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  40.28 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  39.19 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  34.78 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  36.49 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  35.14 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  38.71 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1650  hypothetical protein  34.18 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  35.06 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3398  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  27.59 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  30.67 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  30.67 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1477  hypothetical protein  36 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0622  hypothetical protein  34.43 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000178223  unclonable  0.0000000000835363 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  28.99 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1410  hypothetical protein  29.87 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.314119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2540  hypothetical protein  27.4 
 
 		 101 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  40.54 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>