16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2540 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2540  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  205  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  49.4 
 
 
91 aa  93.6  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  48.1 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  34.57 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  32.86 
 
 
78 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  30.56 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1477  hypothetical protein  30.59 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  33.33 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  28.77 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  28.77 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  23.94 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  27.4 
 
 
85 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1134  hypothetical protein  28.17 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  28.99 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  24.69 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>