202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2283 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2283  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
293 aa  578  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235564  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1982  cell division protein FtsX  68.26 
 
 
293 aa  407  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.983793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1769  protein of unknown function DUF214  70.99 
 
 
294 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00766371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  62.07 
 
 
290 aa  359  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0527  cell division protein, putative  69.18 
 
 
295 aa  353  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000882994  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0427  cell division protein, putative  63.7 
 
 
295 aa  348  6e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  57.29 
 
 
290 aa  335  5.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0634  protein of unknown function DUF214  36.68 
 
 
293 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1243  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.046416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0390  hypothetical protein  30.36 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  27.42 
 
 
295 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1255  protein of unknown function DUF214  35 
 
 
291 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0246  hypothetical protein  30.27 
 
 
294 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.261285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  29.39 
 
 
295 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0951  cell division protein FtsX  25.28 
 
 
309 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4586  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 
297 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2182  cell division protein FtsX  29.33 
 
 
292 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0786  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 
293 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.663734  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  26.46 
 
 
321 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  31.54 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  26.42 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3965  protein of unknown function DUF214  32.8 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000721724  hitchhiker  0.00000000316711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0297  putative cell division protein  27.04 
 
 
302 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000570278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0203  hypothetical protein  30.71 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000250844  decreased coverage  0.00000260823 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0472  protein of unknown function DUF214  26.99 
 
 
296 aa  92.4  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.840554  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04535  putative cell division protein  28.92 
 
 
294 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  23.97 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0285  hypothetical protein  28.33 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  27.61 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  27.12 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0221  hypothetical protein  30.31 
 
 
321 aa  85.5  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.114522  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1536  cell division protein FtsX, putative  28.9 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  24.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  26.13 
 
 
324 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1235  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.43736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  27.87 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  24.88 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  30.09 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  32.93 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2664  cell division protein FtsX  25.56 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.131472  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  28.51 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3544  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  27.85 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.94 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  27.18 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2195  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000249037  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0292  cell division protein, putative  27.36 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000194286  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  29.12 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  24.44 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.16 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  29.53 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0291  hypothetical protein  27.85 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000447855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2399  protein of unknown function DUF214  24.84 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4092  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420483  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0173  hypothetical protein  26.85 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000303587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1759  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.899046  normal  0.32093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  24.84 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  29.78 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.16 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.16 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  28.51 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4293  hypothetical protein  26.51 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  25.16 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  25.16 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  25.16 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  25.16 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.16 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3503  hypothetical protein  27.18 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  27.66 
 
 
300 aa  79  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1922  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000281289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  23.15 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3722  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233251  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.01 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3772  cell division protein FtsX  26.85 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178624  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  26.85 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  28.32 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0567  hypothetical protein  26.42 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3608  hypothetical protein  22.7 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.17 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3845  cell division protein FtsX  26.51 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000185349  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3780  protein of unknown function DUF214  28.14 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  25.16 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1454  Cell division protein-like protein  25.48 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.805507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03535  cell division protein  27.43 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0178612  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20320  cell division protein  25.83 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  27.59 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  25.1 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  25.22 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  25.1 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  25.1 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  29.56 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  26.83 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  22.55 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  26.79 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>