20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0565 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00732681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2960  Methyltransferase type 11  63.49 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  56.52 
 
 		 210 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3209  Methyltransferase type 11  61.11 
 
 		 230 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1209  Methyltransferase type 11  57.25 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  41.92 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1164  methyltransferase domain-containing protein  71.43 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.78 
 
 		 272 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 1162 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  24.5 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  24.55 
 
 		 247 aa  42.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 208 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.21 
 
 		 252 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  25.21 
 
 		 248 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  26.89 
 
 		 240 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  32.22 
 
 		 278 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 289 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 291 aa  41.2  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>