15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0376 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0376  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0516393  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0249  hypothetical protein  81.97 
 
 
307 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2351  hypothetical protein  82.31 
 
 
296 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0215  hypothetical protein  80.82 
 
 
296 aa  502  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000244764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2161  hypothetical protein  80.82 
 
 
303 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.210004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1978  hypothetical protein  76.71 
 
 
296 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.255672  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2211  hypothetical protein  74.66 
 
 
300 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0885584  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08360  hypothetical protein  48.12 
 
 
291 aa  292  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2310  hypothetical protein  49.48 
 
 
300 aa  275  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1731  hypothetical protein  46.85 
 
 
282 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1658  hypothetical protein  45.14 
 
 
282 aa  233  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0535  hypothetical protein  43.45 
 
 
282 aa  231  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.975067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1354  hypothetical protein  44.41 
 
 
280 aa  229  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4121  hypothetical protein  39.93 
 
 
287 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4122  hypothetical protein  38.64 
 
 
292 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>