15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1978 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1978  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.255672  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2211  hypothetical protein  77.03 
 
 
300 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0885584  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2351  hypothetical protein  74.83 
 
 
296 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0249  hypothetical protein  75.17 
 
 
307 aa  475  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0215  hypothetical protein  73.31 
 
 
296 aa  475  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000244764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0376  hypothetical protein  76.71 
 
 
315 aa  477  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0516393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2161  hypothetical protein  77.4 
 
 
303 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.210004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08360  hypothetical protein  51.03 
 
 
291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2310  hypothetical protein  50.69 
 
 
300 aa  293  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1658  hypothetical protein  47.06 
 
 
282 aa  242  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1731  hypothetical protein  48.1 
 
 
282 aa  242  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0535  hypothetical protein  44.48 
 
 
282 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.975067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1354  hypothetical protein  44.41 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4122  hypothetical protein  40.14 
 
 
292 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4121  hypothetical protein  39.8 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>