15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2161 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2161  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.210004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2351  hypothetical protein  81.76 
 
 		 296 aa  508  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0376  hypothetical protein  80.82 
 
 		 315 aa  497  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0516393  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0249  hypothetical protein  78.31 
 
 		 307 aa  495  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0215  hypothetical protein  78.08 
 
 		 296 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000244764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1978  hypothetical protein  77.4 
 
 		 296 aa  483  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.255672  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2211  hypothetical protein  73.24 
 
 		 300 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0885584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08360  hypothetical protein  50 
 
 		 291 aa  299  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2310  hypothetical protein  48.34 
 
 		 300 aa  282  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0535  hypothetical protein  45.86 
 
 		 282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.975067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1731  hypothetical protein  48.61 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1658  hypothetical protein  47.57 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1354  hypothetical protein  45.8 
 
 		 280 aa  235  9e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4121  hypothetical protein  42.52 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4122  hypothetical protein  38.98 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>