38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0881 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0881  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1248  hypothetical protein  81.43 
 
 		 69 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4388  hypothetical protein  50.72 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3178  hypothetical protein  44.26 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00832421  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3822  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0264  hypothetical protein  45.16 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0429  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3194  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2853  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0511  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0493  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1426  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0166  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0676  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1937  putative transmembrane protein  39.06 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0759563  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1642  putative transmembrane protein  39.06 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.115403  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1678  putative transmembrane protein  47.37 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3904  putative transmembrane protein  53.73 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0366  hypothetical protein  35.29 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0317  transmembrane protein  38.6 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2899  hypothetical protein  41.27 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869288  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2760  hypothetical protein  41.27 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6173  hypothetical protein  41.27 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0222  putative transmembrane protein  37.31 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2854  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2843  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238867  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2229  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0241  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2012  hypothetical protein  35.29 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000726923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0186  hypothetical protein  36.92 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3533  hypothetical protein  53.73 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2856  hypothetical protein  53.73 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.401347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0460  hypothetical protein  38.1 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4168  hypothetical protein  37.68 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0329  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.209066  decreased coverage  0.00981736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0548  hypothetical protein  37.68 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0280  hypothetical protein  48.65 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1452  hypothetical protein  32.73 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.965141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>