33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0329 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0329  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.209066  decreased coverage  0.00981736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0186  hypothetical protein  60 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0429  hypothetical protein  66 
 
 
67 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3194  hypothetical protein  64 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0676  hypothetical protein  64 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2853  hypothetical protein  64 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0511  hypothetical protein  64 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0493  hypothetical protein  64 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1426  hypothetical protein  64 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0166  hypothetical protein  64 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0222  putative transmembrane protein  58 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0241  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0131422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3822  hypothetical protein  54.55 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0366  hypothetical protein  56 
 
 
70 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2899  hypothetical protein  55.56 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869288  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2760  hypothetical protein  55.56 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198778  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6173  hypothetical protein  55.56 
 
 
66 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2843  hypothetical protein  53.7 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238867  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2854  hypothetical protein  53.7 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1248  hypothetical protein  46.43 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2229  hypothetical protein  53.7 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0264  hypothetical protein  50.98 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3178  hypothetical protein  47.27 
 
 
83 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00832421  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0460  hypothetical protein  53.7 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23553  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0317  transmembrane protein  47.06 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4168  hypothetical protein  52.46 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1937  putative transmembrane protein  44.9 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0759563  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1642  putative transmembrane protein  44.9 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.115403  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0548  hypothetical protein  58 
 
 
69 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4388  hypothetical protein  43.48 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1678  putative transmembrane protein  44 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0753  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.0231659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0280  hypothetical protein  66.67 
 
 
68 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>